Amir Khan Motaqi fue incluido en la Lista el 25 de enero de 2001 como Ministro de Educación del régimen talibán, por lo que se le aplica lo dispuesto en las resoluciones 1267 (1999) y 1333 (2000) del Consejo de Seguridad de las Naciones Unidas en relación con los actos y actividades de las autoridades talibanas.
Amir Khan Motaqi actuó también como representante de los talibanes en las conversaciones organizadas por las Naciones Unidas durante el régimen talibán.
Amir Khan Motaqi está considerado como un miembro destacado de los talibanes y desempeñó también el cargo de Ministro de Información y Cultura bajo el régimen talibán. En junio de 2007, Amir Khan Motaqi era miembro de un consejo talibán regional. En junio de 2007 era miembro del Consejo Supremo Talibán.